NMR laboratórium

Labor felelős: Dr. Bodor Andrea

Munkatársak: Balázs Attila, Dr. Bodor Andrea, Dudás Erika, Sebák Fanni, Pálfy Gyula, Dr. Láng András, Koltai András, dr. Szalainé Dr. Ágoston Bianka, Dr. Rovó Petra

Összhangban a modern bioNMR spektroszkópia célkitűzéseivel, laboratóriumunkban polipeptidek és fehérjék térszerkezet-meghatározását, belső dinamikai tulajdonságaik feltérképezést, intermolekuláris kölcsönhatásokkal, kötődésekkel, valamint fel- és letekeredésükkel kapcsolatos szerkezeti problémákat oldunk meg. Nagy hozzáadott értéket képviselő atomi felbontású adataink felölelik a rövidebb polipeptidek, a nagyobb és a belsőleg rendezetlen fehérjék, valamint a szupramolekuláris nano rendszerre széles körét. Örömmel segítjük kémikus és biokémikus kollégáinkat szaktudásunkkal, hogy kutatási területükön több és jobb molekuláris szintű információhoz juthassanak.

Laboratórium hírei

  • VIP cikkünk a ChemEurJ.-ben

    Cover

    Izgalmas eredmények, új adatok a világ talán legkisebb feltekeredett fehérjéjéről. Atomi felbontás látható és „láthatatlan” téralkatokról: NMR és termodinamikai paraméterek meghatározása egy újonnan kidolgozott algoritmus segítségével. elérhetősége

      Figure2 Tc5b Hsqc

Közlemények

  • Zoltán Gáspári , András Perczel
    Protein dynamics as reported by NMR
    Annu. Rep. NMR Vol. 71, in press (2010)
  • Zoltán Gáspári , Annamária F. Ángyán , Somdutta Dhir , Dino Franklin , András Perczel , Alessandro Pintar , Sándor Pongor
    Probing dynamic protein ensembles with atomic proximity measures
    Curr. Protein Pept. Sci. 11(7):515-522. | DOI: 10.2174/138920310794109201 | PMID: 20887264 (2010) Kivonat
  • Zoltán Gáspári , Péter Várnai , Balázs Szappanos , András Perczel
    Reconciling the lock-and-key and dynamic views of canonical serine protease inhibitor action
    FEBS Lett. 584(1):203-206. | DOI: 10.1016/j.febslet. | PMID: 19932101 (2010) Kivonat
  • Katalin E. Kövér , Tamás Beke , András Lipták , András Perczel
    Combined NMR three-bond scalar coupling measurements and QM calculations to calculate OH-rotamer equilibrium of polyalcohols
    J. Comput. Chem. 30:540-550. (2009) Kivonat
  • Zsuzsa Hódi , Attila L. Németh , László Radnai , Csaba Hetényi , Katalin Schlett , Andrea Bodor , András Perczel , László Nyitray
    Alternatively spliced exon B of myosin Va is essential for binding the tail-associated light chain shared by dynein
    Biochemistry 45:12582-12595. (2006) Kivonat
  • Zotter A , Oláh J , Hlavanda E , Bodor A , Perczel A , Szigeti K , Fidy J , Ovádi J
    Zn(2+)-induced rearrangement of the disordered TPPP/p25 affects its microtubule assembly and GTPase activity.
    BIOCHEMISTRY 50:(44) pp. 9568-9578. (2011) Kivonat
  • Annette Duelli , Bence Kiss , Ida Lundholm , Andrea Bodor , Maxim V. Petoukhov , Dmitri I. Svergun , László Nyitray , Gergely Katona
    The C-terminal random coil region tunes the Ca²⁺-binding affinity of S100A4 through conformational activation
    PLoS One 9(5):e97654 | DOI: 10.1371/journal.pone.0097654 | PMID: 24830809 (2014) Kivonat
  • Andrea Bodor , László Radnai , Csaba Hetényi , Péter Rapali , András Láng , Katalin E. Kövér , András Perczel , Weixiao Y. Wahlgren , Gergely Katona , László Nyitray
    DYNLL2 Dynein Light Chain Binds to an Extended Linear Motif of Myosin 5a Tail That Has Structural Plasticity
    Biochemistry 53(45):7107-7122. | DOI: 10.1021/bi500574z | PMID: 25312846 (2014) Kivonat
  • Andrea Bodor , Katalin E. Kövér , Lena Mäler
    Membrane interactions in small fast-tumbling bicelles as studied by 31P NMR
    BBA Biomembranes 1848(3):760-766. | DOI: 10.1016/j.bbamem.2014.12.001 | PMID: 25497765 (2015) Kivonat
  • Anita Alexa , Gergő Gógl , Gábor Glatz , Ágnes Garai , András Zeke , János Varga , Erika Dudás , Norbert Jeszenői , Andrea Bodor , Csaba Hetényi , Attila Reményi
    Structural assembly of the signaling competent ERK2–RSK1 heterodimeric protein kinase complex
    Proc. Natl. Acad. Sci. USA 112(9):2711-2716. | DOI: 10.1073/pnas.1417571112 | PMID: 25730857 (2015) Kivonat
  • Gergő Gógl , Anita Alexa , Bence Kiss , Gergely Katona , Mihály Kovács , Andrea Bodor , Attila Reményi , László Nyitray
    Structural basis of Ribosomal S6 Kinase 1 (RSK1) inhibition by S100B Protein: modulation of the Extracellular Signal-regulated Kinase (ERK) signaling cascade in a calcium-dependent way
    J. Biol. Chem. 291(1):11-27. DOI: 10.1074/jbc.M115.684928 | PMID: 26527685 (2016) Kivonat
  • Gyula Pálfy , Bence Kiss , László Nyitray , Andrea Bodor
    Multi-level changes in protein dynamics upon complex formation of the calcium-loaded S100A4 with a non-muscle myosin IIA tail fragment
    ChemBioChem 17(19):1829-1838 DOI: 10.1002/cbic.201600280 | PMID: 27418229 (2016) Kivonat