Bemutatkozás
Számos hazai és külföldi kutatócsoporttal működünk együtt a szerves kémia, a molekuláris biológiai és biokémiai különböző területén. Több ELTE központú, egyetemeket és kutatóintézeteket összekapcsoló, akár országos szintű pályázatot vezetünk, mint például a MedInProt, HunProtExc, vagy a SzintPlusz Kiválósági Programok. Foglalkozunk cukor-aminosavak totálszintézisével, béta-peptidek konformáció vizsgálatával, foldamerek előállításával, a II-típusú cukorbetegség gyógyításában használt Exendin-4 típusú GLP-1 analógok expressziójával és szerkezetvizsgálatával, az Alzheimer-kór molekuláris hátterének mélyebb megértését célzó kutatásokkal, vagy a tumoros megbetegedésekben fontos szerepet betöltő kRas jelátviteli fehérje térszerkezetvizsgálatával. Szeretettel várunk minden érdeklődő diákot, a kutatás iránt érdeklődő hallgatót vagy vendégkutatót.
Híreink
-
Nagy affinitású kötődés egy flexibilis fehérje-fehérje komplexben: kalmodulin-melittin komplex szerkezetvizsgálata
A kalmodulin és melittin kölcsönhatását elterjedten alkalmazzák új módszerek kidolgozásának teszt rendszereként, és referenciaként kalmodulin kölcsönhatásvizsgálatokban – azonban a komplex kölcsönhatási mintázatára vonatkozó eddigi tanulmányok ellentmondásos eredményre vezettek. Ennek a kölcsönhatásnak a feltérképezését tűztük ki célul. Krisztallográfiai vizsgálatokkal többféle kötődési módot azonosítottunk, MD szimulációkkal pedig bizonyítottuk, hogy ezek átalakulnak egymásba: „csúszkáló” kötődési móddal, cserélődő kölcsönhatásokkal valósul meg a nanomólos affinitású kötődés.
A publikáció bekerült az „Editors' Pick Selection” válogatásba a Journal of Biological Cheimstry folyóiratnál. -
A KRasG12C kovalens fragmentum feltérképezése új kemotípusokat mutatott ki
A KRas G12C mutáns specifikus kovalens inhibitorokat terveztünk és állítottunk elő. Egy kovalens elektrofil fragmens-könyvtárat készítettünk, amely molekulavázait mintegy 40 különböző elektrofil funkcióscsoporttal láttunk el és céloztuk így meg a Cys12-t azért, hogy megfelelő vezérmolekulákat tudjunk azonosítani. A szűrés Ellman-féle szabad tiol, fehérje NMR és sejtéletképességi vizsgálatokon alapult. Két potenciális inhibitort azonosítottunk.
Eredményünk a European Journal of Medicinal Chemistry-ben olvasható.
-
Egy emlős szerin proteázt gátló karbapenem antibiotikum: az acilaminoacil peptidáz-meropenem komplex szerkezete
Krio-elektronmikroszkópia segítségével meghatároztuk az emberi szervezetben is megtalálható, a fehérjék minőségbiztosítási folyamataiban jelentős szerepet játszó acilpeptid-hidroláz enzim modelljének szerkezetét. Legjobb tudomásunk szerint ez az első olyan szerkezetet, amiben
egy antibiotikum (a meropenem) molekula teljes gátló hatást fejt ki egy emlős fehérjén.
A közlemény a hét választása (Pick of the Week) lett és címlapra került.Eredményünk a Chemical Science-ben olvasható: https://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2022/SC/D2SC05520A
- további hírek
Közleményeink
-
Dóra Nagy-Fazekas , Pál Stráner , Péter Ecsédi , Nóra Taricska , Adina Borbély , László Nyitray , András Perczel
A Novel Fusion Protein System for the Production of Nanobodies and the SARS-CoV-2 Spike RBD in a Bacterial System
Bioengineering 10(3), 389 I DOI: 10.3390/bioengineering10030389 (2023) Kivonat -
Zsolt Dürvanger , Tünde Juhász , Károly Liliom , Veronika Harmat
Structures of calmodulin–melittin complexes show multiple binding modes lacking classical anchoring interactions
J. Biol. Chem. 299(4): 104596 I DOI: 10.1016/j.jbc.2023.104596 (2023) Kivonat -
Zoltán Orgován , Nikolett Péczka , László Petri , Péter Ábrányi-Balogh , Ivan Ranđelović , Szilárd Tóth , Gergely Szakács , Kinga Nyíri , Beáta Vértessy , Gyula Pálfy , István Vida , András Perczel , József Tóvári , György M. Keserű
Covalent fragment mapping of KRasG12C revealed novel chemotypes with in vivo potency
European Journal of Medicinal Chemistry 250, 115212, ISSN 0223-5234 I DOI: 10.1016/j.ejmech.2023.115212. (2023) Kivonat -
Anna J. Kiss-Szemán , Luca Takács , Zoltán Orgován , Pál Stráner , Imre Jákli , Gitta Schlosser , Simonas Masiulis , Veronika Harmat , Dóra K. Menyhárd , András Perczel
A carbapenem antibiotic inhibiting a mammalian serine protease: structure of the acylaminoacyl peptidase–meropenem complex
Chemical Science 13, 14264 - 14276 I DOI: 10.1039/D2SC05520A (2022) Kivonat -
Ágnes Ábrahám , Flavio Massignan , Gergő Gyulai , Miklós Katona , Nóra Taricska , Éva Kiss
Comparative Study of the Solid-Liquid Interfacial Adsorption of Proteins in Their Native and Amyloid Forms
Int. J. Mol. Sci. 23(21), 13219 I DOI: 10.3390/ijms232113219 (2022) Kivonat - további közlemények