Bemutatkozás
Számos hazai és külföldi kutatócsoporttal működünk együtt a szerves kémia, a molekuláris biológiai és biokémiai különböző területén. Több ELTE központú, egyetemeket és kutatóintézeteket összekapcsoló, akár országos szintű pályázatot vezetünk, mint például a MedInProt, HunProtExc, vagy a SzintPlusz Kiválósági Programok. Foglalkozunk cukor-aminosavak totálszintézisével, béta-peptidek konformáció vizsgálatával, foldamerek előállításával, a II-típusú cukorbetegség gyógyításában használt Exendin-4 típusú GLP-1 analógok expressziójával és szerkezetvizsgálatával, az Alzheimer-kór molekuláris hátterének mélyebb megértését célzó kutatásokkal, vagy a tumoros megbetegedésekben fontos szerepet betöltő kRas jelátviteli fehérje térszerkezetvizsgálatával. Szeretettel várunk minden érdeklődő diákot, a kutatás iránt érdeklődő hallgatót vagy vendégkutatót.
Híreink
-
Tömör amiloid és nonamiloid minták a hexapeptidekben
Az összesen 64 millió, 6 hosszú oligopeptidek közül a „Budapest Amiloid Prediktor” mesterséges intelligencia program alapján meghatároztuk a vélhetőleg erősen amiloidogén mintázatokat, például a CxFLWx, FxFLFx, vagy az xxIVIV hexapeptidet. Összesen 5531 ilyen mintázatra derül fény!
Eredményünk az ACS Publications-ben olvasható: https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acsomega.2c02513
-
Az Mg2+-mentes állapot jelentősége az onkogén K-Ras mutánsok nukleotidcseréjében
Az NMR relaxációs és az MD szimulációs adatokra támaszkodva vizsgáltuk mind a vad, mind 3 K-Ras onkogén mutáns esetében a lassú időskálájú (ms) belső dinamika szerepét. Egy 2-állapotú konformációs kicserélődési modellt alkottunk mind a GDP, mind a K-Ras GTP-kötött formákra.
Eredményeink a Chemistry Europe folyóiratban olvashatók: https://doi.org/10.1002/chem.202201449
-
Az Omicron-receptor-kötő tartomány kapcsolatelemzése és dinamikája az ACE2-vel komplexben
Molekula-dinamikai szimulációkkal vizsgáltuk a vad típusú, illetve az Omicron-variáns SARS-CoV-2 S-fehérjéjének receptorkötő domainje és a humán ACE2 enzim között létrejövő komplex szerkezetét és dinamikáját. Munkánk eredményeképp rájöttünk, hogy a két komplex mind aminosav-kölcsönhatások szintjén, mind pedig mozgékonyság szempontjából nagy különbségeket mutat.
Eredményeink a Journal of Chemical Information and Modelling folyóiratban olvashatók: https://doi.org/10.1021/acs.jcim.2c00397
- további hírek
Közleményeink
-
Ágnes Ábrahám , Flavio Massignan , Gergő Gyulai , Miklós Katona , Nóra Taricska , Éva Kiss
Comparative Study of the Solid-Liquid Interfacial Adsorption of Proteins in Their Native and Amyloid Forms
Int. J. Mol. Sci. 23(21), 13219 I DOI: 10.3390/ijms232113219 (2022) Kivonat -
Zsolt Gulyás , Blanka Moncsek , Kamirán Áron Hamow , Pál Stráner , Zoltán Tolnai , Eszter Badics , Norbert Incze , Éva Darkó , Valéria Nagy , András Perczel , László Kovács , Vilmos Soós
D27-LIKE1 isomerase has a preference towards trans/cis and cis/cis conversions of carotenoids in Arabidopsis
The Plant Journal DOI: 10.1111/tpj.16017 (2022) Kivonat -
László Keresztes , Evelin Szögi , Bálint Varga , Viktor Farkas , András Perczel , Vince Grolmusz
Succinct Amyloid and Nonamyloid Patterns in Hexapeptides
ACS Omega DOI: 10.1021/acsomega.2c02513 (2022) Kivonat -
János Szolomajer , Pál Stráner , Zoltán Kele , Gábor K. Tóth , András Perczel
Synthesis of the extracellular domain of GLP-1R by chemical and biotechnological approaches
RSC Advances 12: 24278-24287 | DOI: 10.1039/d2ra02784d (2022) Kivonat -
Zsolt Fazekas , Dóra K. Menyhárd , András Perczel
Omicron Binding Mode: Contact Analysis and Dynamics of the Omicron Receptor-Binding Domain in Complex with ACE2
Journal of Chemical Information and Modelling DOI: 10.1021/acs.jcim.2c00397 (2022) Kivonat - további közlemények