Kinetikai, termodinamikai és ab initio betekintés az AsnGly izomerizációba, mint a fehérjék integritásának ketyegő időzített bombájábaa

Published 2024. december 20., péntek, 14:23

Újabban megjelent cikkünkben az aszparagin-glicin (-NG-) szekvenciát tartalmazó Ac-NGXA-NH2 (X = K(+): lizin, R(+): arginin, A: alanin or E(-): glutaminsav) peptidek spontán izomerizációs reakcióját vizsgáltuk a pH, hőmérséklet és kémiai összetétel függvényében. Bemutattunk egy kvantitatív NMR adatokon alapuló kinetikai és termodinamikai modellt annak érdekében, hogy koherens és kvantitatív képet kapjunk az átalakulásról. Az izomerizáció reakciósebesség meghatározó lépését, ami az -NG- molekularészlet dezamidációja és gyűrűzáródása, IRC és NBO analízissel igyekeztünk részletesebben felderíteni. A gyűrűzáródás végéig 4-6 kulcsszerkezetet sikerült beazonosítanuk, valamint az átalakulás töltés és szerkezeti paramétereit is feltérképeztük.

Graphical Abstract Juditnak

Back to all news