Krisztallográfiai Laboratórium

Labor felelős: Dr. Harmat Veronika

Munkatársak: Dürvanger Zsolt, Forray Dániel, Dr. Harmat Veronika, Hegedűs Gergő, Dr. Karancsiné Dr. Menyhárd Dóra, Kiss-Szemán Anna, Sulyok-Eiler Máté

Laboratóriumunkban fehérjék és fehérje-komplexek, valamint kismolekulás röntgenkrisztallográfiai vizsgálatot végzünk. Célunk a térszerkezet atomi szintű felderítésén keresztül egyes biológiai makromolekulák működésének és kölcsönhatásaiknak pontosabb megértése. Feladataink közé tartozik egyes szerves szintetikus, fémorganikus és bio-molekula fizikai-kémiai tulajdonságainak és térszerkezeti paramétereinek a felderítése, esetenkénti korrelációja. 2018-ban - két VEKOP pályázat példaértékű széles összefogása keretében - megvalósítottuk a krisztallográfiai műszerparkunk teljeskörű felújítását. Nyitott laboratóriumként az ELTE-CrystalLAB célkitűzése a kutatási igények minél szélesebb körének kiszolgálása. TTP Labtech Mosquito kristályosító robotunknak köszönhetően a kristályosító körülmények hatékony és automatizált előszűrését tudjuk megvalósítani akár vizesoldatok, akár lipid mezofázisok felhasználásával. A kristályosítási kísérletek kiértékelése a Formulatrix Rock Imager 2 félautomata mikroszkóppal történik. A kismolekulás és fehérjekrisztallográfiai méréseket és egyes kristályok in situ tesztelését Rigaku XtaLAB Synergy-R röntgendiffraktométerünkkel végezzük. A hazai készülékek közül a mi készülékünk rendelkezik a legnagyobb röntgensugár-intenzitással, így lehetővé téve a kristályok igen széles körének vizsgálatát.

*A VEKOP-2.3.3-15-2017-00018 és VEKOP-2-3-2-16-2017-00014 projektek keretében folyó kutatásokat az Európai Unió és Magyarország Kormánya támogatta az Európai Regionális Fejlesztési Alap hozzájárulásával.

Laboratórium hírei

  • Röntgendiffrakciós adatgyűjtés szinkrotron sugárforrásoknál

    Az ESRF és BESSY európai szinrotronoknál végeztünk adatgyűjtést mikrofókusz sugárforrásoknál.

    Szinkr1

  • Ünnepélyes tudományos ülés az Akadémián a Krisztallográfia Nemzetközi Éve alkalmából

    Részt vettünk a május 8.-án at MTA Fizikai Tudományok Osztálya, Kémia Tudományok Osztálya és Biológiai Tudományok Osztálya közös tudományos ülésén, amit a Krisztallográfia Nemzetközi Éve alkalmából rendeztek. Egy, a magyarországi fehérjekrisztallográfia kezdeteihez visszanyúló együttműködésnek, az prolil-oligopeptidáz enzimcsalád szerkezeti/működési összefüggései felderítésének eredményeit mutattuk be.

    Iycr Square 190x182

  • Kiállítás: Szépség és szimmetria a kristályok világában

    Kiállítók: A Krisztallográfiai Unió Magyar Tagozatának Bizottsága és Kovács Attila festőművész

    Kiall 2Kiall 1

    A krisztallográfia nemzetközi éve (2014.) alkalmából rendezett kiállítás központi gondolata a transzlációs szimmetria. A szabályosan ismétlődő motívumok meghatározó elemei számos művészeti alkotásnak. Ugyanakkor a modern tudományban a kristály fogalma szintén transzlációs (eltolási) szimmetriát mutató rendre épül: az anyag mikroszkopikus, atomi felépítésében mutatkozó rendre. A transzlációs szimmetria fogalama köré csoportosulnak mind a tudományos kutatás eredményeit mutató ábrák, mind Kovács Atilla alkotásai.

    A kiállítást megnyitja: Faigel Gyula akadémikus, a Nemzetközi Krisztallográfiai Unió Magyar Tagozatának elnöke
    Megnyitó: 2013. november 20. 14 óra
    Helyszín: Magyar Tudományos Akadémia Könyvtára, Vasarely-terem (Bp. Arany János u. 1.)
    A kiállítás 2013. november 27-ig tekinthető meg, hétfőtől péntekig 10-től 18 óráig.

Közlemények

  • Dóra K. Menyhárd , Zoltán Orgován , Zoltán Szeltner , Ilona Szamosi , Veronika Harmat
    Catalytically distinct states captured in a crystal lattice: the substrate-bound and scavenger states of acylaminoacyl peptidase and their implications for functionality
    Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. 71(Pt 3):461-472. | DOI: 10.1107/S1399004714026819 | PMID: 25760596 (2015) Kivonat
  • Veronika Harmat , Klarissza Domokos , Dóra K. Menyhárd , Anna Palló , Zoltán Szeltner , Ilona Szamosi , Tamás Beke , Gábor Náray-Szabó , László Polgár
    Structure and catalysis of acylamonoacyl peptidase: closed and open subunits of a dimer oligopeptidase
    Journal of Biological Chemistry 286:1987-1998. PMID: 21084296 | DOI: 10.1074/jbc.M110.169862 (2011) Kivonat
  • Dóra K. Menyhárd , Anna Kiss-Szemán , Éva Tichy-Rács , Balázs Hornung , Krisztina Rádi , Zoltán Szeltner , Klarissza Domokos , Ilona Szamosi , Gábor Náray-Szabó , László Polgár , Veronika Harmat
    A self-compartmentalizing hexamer serine protease from Pyrococcus horikoshii: substrate selection achieved through multimerization
    J Biol Chem 288(24):17884-17894. | DOI: 10.1074/jbc.M113.451534 | PMID: 23632025 (2013) Kivonat
  • Anna J. Kiss-Szemán , Veronika Harmat , Dóra K. Menyhárd
    Achieving Functionality Through Modular Build-up: Structure and Size Selection of Serine Oligopeptidases
    Current Protein & Peptide Science 1089 - 1101 DOI:10.2174/1389203720666190925103339 (2019) Kivonat
  • Valéria Bugris , Veronika Harmat , Györgyi Ferenc , Sándor Brockhauser , Ian Carmichael , Elspeth F. Garman
    Radiation-damage investigation of a DNA 16-mer
    Journal of Synchrotron Radiation 998-1009 doi.org/10.1107/S160057751900763X (2019) Kivonat
  • Zsolt Dürvanger , Veronika Harmat
    Structural Diversity in Calmodulin - Peptide Interactions
    Current Protein & Peptide Science 1102 - 1111 doi.org/10.2174/1389203720666190925101937 (2019) Kivonat
  • József Dobó , Veronika Harmat , László Beinrohr , Edina Sebestyén , Péter Závodszky , Péter Gál
    MASP-1, a Promiscuous Complement Protease: Structure of Its Catalytic Region Reveals the Basis of Its Broad Specificity
    J. Immunol. 183:1207-1214. (2009) Kivonat
  • László Beinrohr , Veronika Harmat , József Dobó , Zsolt Lörincz , Péter Gál , Péter Závodszky
    C1 inhibitor serpin domain structure reveals the likely mechanism of heparin potentiation and conformational disease
    J. Biol. Chem. 282: 21100-21109. (2007) Kivonat
  • Márton Megyeri , Veronika Harmat , Balázs Major , Ádám Végh , Júlia Balczer , Dávid Héja , Katalin Szilágyi , Dániel Datz , Gábor Pál , Péter Závodszky , Péter Gál , József Dobó
    Quantitative characterization of the activation steps of Mannan-Binding Lectin (MBL)-Associated Serine Proteases (MASPs) points to the central role of MASP-1 in the initiation of the complement lectin pathway
    J Biol Chem 288(13):8922-8934. | DOI: 10.1074/jbc.M112.446500 | PMID: 23386610 (2013) Kivonat
  • Viktória Goldschmidt Gőz , István Pintér , Veronika Harmat , András Perczel
    Approaches to Pyranuronic beta-Sugar Amino Acid Building Blocks of Peptidosaccharide Foldamers
    Eur. J. Org. Chem. 355-361. DOI: 10.1002/ejoc.201701612 (2018) Kivonat
  • Tibor Pasinszki , Dániel Dzsotján , Győző György Lajgut , Veronika Harmat , Antal Csámpai , Andrea Bor , István Zupkó
    Synthesis, spectral- and theoretical study, x-ray analysis, and antiproliferative activity of 4,5-dihydrobenzoferroceno[1,2-d][1,2,3]selenadiazole and its benzo-fused analogue
    Journal of Organometallic Chemistry 863:70-76. | DOI: 10.1016/j.jorganchem.2018.03.031 (2018) Kivonat
  • Roland Szalay , Veronika Harmat , János Eőri , Gábor Pongor
    Strong influence of intramolecular Si⋯O proximity on reactivity: Systematic molecular structure, solvolysis, and mechanistic study of cyclic N-trimethylsilyl carboxamide derivatives
    Tetrahedron Letters 58(23):2186-2192. | DOI: 10.1016/j.tetlet.2017.04.057 (2017) Kivonat
  • Anikó Angyal , András Demjén , Veronika Harmat , János Wölfling , László G. Puskás , Iván Kanizsai
    1,3-Dipolar Cycloaddition of Isatin-Derived Azomethine Ylides with 2H‐Azirines: Stereoselective Synthesis of 1,3- Diazaspiro[bicyclo[3.1.0]hexane]oxindoles
    The Journal of Organic Chemistry 4273-4281 DOI: 10.1021/acs.joc.9b00242 (2019) Kivonat
  • Kinga Judit Fodor , Dániel Hutai , Tamás Jernei , Angéla Takács , Zsófia Szász , Máté Sulyok-Eiler , Veronika Harmat , Rita Oláh Szabó , Gitta Schlosser , Ferenc Hudecz , László Kőhidai , Antal Csámpai
    Novel Polycondensed Partly Saturated β-Carbolines Including Ferrocene Derivatives: Synthesis, DFT-Supported Structural Analysis, Mechanism of Some Diastereoselective Transformations and a Preliminary Study of their In Vitro Antiproliferative Effects
    Molecules 25(7), 1599 | doi: 10.3390/molecules25071599 (2020) Kivonat